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Biologie moléculaire

Aller en bas • 22 r�ponses • 2 pages • 1 2
Piloux
Sexternus-minus

Messages : 37
Enregistré : 09/08/2013
Posté le 28/11/2013 � 14:48 notnew
Salut ! Est ce que quelqu'un pourrait m'expliquer ce qu'est un SNV (single nucleodide variant en anglais) ? Merci smilies
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Zoey
Doyenne (espèce rare)

Messages : 527
Enregistré : 23/02/2013
Posté le 28/11/2013 � 14:57 notnew
Bonjour,

En faisant de la traduction vite-fait (l'anglais n'est pas mon point fort !), je dirais que c'est un nucléotide qui est changé dans ton ADN, ce qui impliquerait soit une mutation silencieuse, faux-sens ou non sens sans décalage du cadre de lecture car ce serait une substitution d'un nucléotide.

En espérant avoir pu t'aidé smilies

(si un bilingue passe par là ... ^^)
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Piloux
Sexternus-minus

Messages : 37
Enregistré : 09/08/2013
Posté le 28/11/2013 � 18:19 notnew
Merci pour cette réponse rapide ^^ Mais alors c'est quoi la différence avec SNP (single nucleotide polymorphism en anglais) ?
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Zoey
Doyenne (espèce rare)

Messages : 527
Enregistré : 23/02/2013
Posté le 28/11/2013 � 18:34 notnew
Le polymorphisme a lieu si le phénotype n'est pas touché. Il y a bien un changement dans la séquence mais très peu de modifs dans le métabo, a contrario de la mutation, ce qui serait le SNP. Mais je n'ai pas ces notions dans mon cours donc j'espère ne pas te dire de bêtise ! Mais ça me semble logique smilies
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Piloux
Sexternus-minus

Messages : 37
Enregistré : 09/08/2013
Posté le 29/11/2013 � 11:12 notnew
Merci pour tes réponses ! smilies
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Hookie
Interne

Messages : 135
Enregistré : 14/10/2012
Posté le 29/11/2013 � 13:53 notnew
Bonjour,


J'ai l'impression que SNV et SNP veulent dire la même chose nan ? Car dans mon cours, on a dit que SNP était une variation d'un nucléotide entre 2 séquences génomiques.

Après, sachant que pour qu'il y ait polymorphisme, il faut que le variant ait une fréquence supérieure ou égale à 1% dans la population, c'est peut-être là qu'est la différence (SNV = variant qui n'est pas forcément un polymorphisme et SNP variant qui en est un)
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Zoey
Doyenne (espèce rare)

Messages : 527
Enregistré : 23/02/2013
Posté le 29/11/2013 � 14:11 notnew
Salut,

En effet, j'avais oublié l'histoire du 1%, et ça explique très bien du coup !
Après, je ne connais pas les profs de ta fac, mais je ne pense pas qu'ils vont demander la différence smilies
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Piloux
Sexternus-minus

Messages : 37
Enregistré : 09/08/2013
Posté le 30/11/2013 � 11:44 notnew
Huuum, je vois a peu près ce que vous voulez dire ^^ Si, justement, les profs demandent de pouvoir differencier smilies
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Askah
Externe (diplomé secrétariat médical)

Messages : 75
Enregistré : 22/03/2012
Posté le 30/11/2013 � 19:08 notnew
Le polymorphisme a lieu si le phénotype n'est pas touché. Il y a bien un changement dans la séquence mais très peu de modifs dans le métabo, a contrario de la mutation, ce qui serait le SNP.

Le phénotype peut être touché dans le polymorphisme, c'est ce qui fait la différence entre les individus d'une espece. Soit ta mutation est silencieuse, soit elle va te donner un truc cool comme la couleur des yeux, soit un truc pas cool comme une susceptibilité à une maladie.

La différence entre SNP et SNV c'est la fréquence, un SNV sera plus deletere qu'un SNP (selection naturelle)
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Piloux
Sexternus-minus

Messages : 37
Enregistré : 09/08/2013
Posté le 01/12/2013 � 09:51 notnew
Oui, je vois ! Mais comment savoir si telle ou telle mutation est une SNP ou SNV, c'est ça ce que je comprend pas ... Dans les énoncés, il n'y a pas d'informations concernant les fréquences & autres !
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corto maltese
Ministre de la Santé

Messages : 1665
Enregistré : 14/06/2011
Posté le 01/12/2013 � 13:09 notnew
Oui, je vois ! Mais comment savoir si telle ou telle mutation est une SNP ou SNV, c'est ça ce que je comprend pas ... Dans les énoncés, il n'y a pas d'informations concernant les fréquences & autres !

clairement c'est enculer des mouches pour savoir si c'est variations ou polymorphism ^^je doute qu'on t'emmerde la dessus !
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Amat Victoria curam
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Askah
Externe (diplomé secrétariat médical)

Messages : 75
Enregistré : 22/03/2012
Posté le 01/12/2013 � 19:53 puis édité 1 fois notnew
C'est quoi les questions qu'ils posent?
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corto maltese
Ministre de la Santé

Messages : 1665
Enregistré : 14/06/2011
Posté le 01/12/2013 � 20:20 notnew
ça depend de ta fac, mais moi ils essayaient de nous melanger les pinceaux avec les autres types de mutation, les microsatellites ou les CNV par exemple.
Mais je pense pas que la distinction SNP OU SNV soit vraiment un element important
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Amat Victoria curam
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Piloux
Sexternus-minus

Messages : 37
Enregistré : 09/08/2013
Posté le 03/12/2013 � 10:01 notnew
Je suis à Lyon Est, et par exemple dans un meme QCM, je suis tombée plusieurs fois sur des items "C'est un SNP", "C'est un SNV" ... Donc je pense que notre prof d'UE 1 veut qu'on sache la difference ...
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Zoey
Doyenne (espèce rare)

Messages : 527
Enregistré : 23/02/2013
Posté le 03/12/2013 � 10:33 notnew
Salut,

Dans ce cas-là, quelles sont les infos données dans l'énoncé pour un item comme ça ? Si tu décortiques les infos, ça devrait se corréler avec la définition smilies
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Malikemal
Chef des sévices

Messages : 361
Enregistré : 17/03/2013
Posté le 03/12/2013 � 15:26 notnew
C'est Momo snormal smilies A LE, la définition de notre cher prof c'est SNP si plus de 1% de la pop (ou d'une certaine pop genre les caucasiens), cherche pas plus loin. Après faut faire attentio aux items qui disent "Il se pourrait que ce soit un SNP" => voir l'ED de T. !
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Promotion R.T.H. Laennec
Tuteur de MEAG
Responsable Ronéo FGSM2
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Piloux
Sexternus-minus

Messages : 37
Enregistré : 09/08/2013
Posté le 03/12/2013 � 17:42 notnew
Donc un SNV, c'est une mutation qui touche moins 1% de la population c'est bien ça ? ( vraiment désolée, mais j'ai trop du mal avec les pseudo définitions du prof! )
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Zoey
Doyenne (espèce rare)

Messages : 527
Enregistré : 23/02/2013
Posté le 03/12/2013 � 18:58 notnew
Bonsoir,

Alors on peut résumer :
- SNP: fréquence >1% de la population totale, pas de gros changement au niveau du phénotype
- SNV : fréquence
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Hookie
Interne

Messages : 135
Enregistré : 14/10/2012
Posté le 05/12/2013 � 19:04 notnew
Bonsoir,

Je me permets de poser une question ici vu qu'elle porte sur les mêmes notions :

Dans mon cours, il est écrit qu'un variant a une conséquence fonctionnelle mais sans phénotype pathologique.. ça veut dire quoi concrétement ? smilies

Thanks smilies
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Zoey
Doyenne (espèce rare)

Messages : 527
Enregistré : 23/02/2013
Posté le 05/12/2013 � 19:23 notnew
Dans mon cours, il est écrit qu'un variant a une conséquence fonctionnelle mais sans phénotype pathologique.. ça veut dire quoi concrétement ?

Bonsoir,

Imagine une protéine qui agit sur une fonction cellulaire. Si cette protéine est tronquée ou gain de fonction, modification de cette fonction cellulaire, donc problème fonctionnelle. Mais le corps peut trouver des mécanismes de compensation donc pas de phénotype pathologique smilies

Je n'ai pas d'exemples précis, si un me vient, je te le mettrai smilies
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Hookie
Interne

Messages : 135
Enregistré : 14/10/2012
Posté le 05/12/2013 � 19:35 notnew
Ouais je vois smilies En fait c'est pas que je comprends pas, c'est que j'ai du mal à me représenter ce que ça peut donner. Pour une mutation délétère bah c'est simple, la mutation est responsable d'une maladie, pour un variant neutre ça peut être la couleur des yeux, mais un variant...je ne vois pas d'exemple et ça me perturbe ! smilies
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